פרופ' דוד קרסיק
אפידמיולוגיה גנטית של מחלות שכיחות באוכלוסייה
CV
פרופ' קרסיק הוא פרופסור מן המניין החוקר גנטיקה של מחלות שריר-שלד.
Research
המחקר במעבדתנו עוסק בבסיס התורשתי של תהליכים ומחלות הקשורות בזקנה, ביניהן מחלות כגון דילול עצם (osteoporosis) ודילול שריר (sarcopenia) ומגוון הפרעות הקשורות במערכת השלד (כגון הסינדרום המטבולי). לצורך הבנה וחקר מעמיק של תהליכים אלה, הקמנו במהלך השנה האחרונה מתקן חדשני לגידול דגי זברה. דג זה משמש כאורגניזם מודל, בעזרתו אנו בוחנים את המנגנונים הגנטיים והמולקולריים המשפיעים על האינטראקציות הקיימות במערכת שריר-שלד. במסגרת המחקר אנו משתיקים גנים מועמדים שונים, החשודים כמשפיעים על בניית מערכת השלד החל מהשלב העוברי של דג הזברה, באמצעות הזרקה של מולקולות עם מודיפיקציות כימיות (מורפולינו) לביצית כאשר היא בשלבי חלוקה ראשוניים. במקביל אנו מנסים ליצור קווי דגים מוטנטים אשר חסרים הגנים הקשורים גם הם למערכת שריר-עצם באופן קבוע. בשני המקרים, הן של השתקה והן של מוטגנזה אנו בוחנים את ההשפעה על התפתחות מערכת שריר-עצם בשלב הלרווה ובדג הבוגר. לצורך אומדן השינויים הנגרמים לפנוטיפ של העצמות אנו עומדים בפני רכישת מכשיר דימות משוכלל מסוג מיקרו-סיטי המיועד לבדיקות עצם בבעלי חיים קטנים.
במחקר נוסף, אנו משתמשים בעכברים כאורגניזם מודל להתפתחות של עצם תחת השפעות אפיגנטיות.
במעבדה אנו משתמשים בשיטות ניתוח של גנטיקה כמותית קלאסית, סטטיסטיקה גנטית וכן כלים ביואינפורמטיים שונים: Expression QTL analysis, Genome-wide association studies, Pathway analysis;
לצורך ביצוע מיפויים גנטיים. בנוסף אנו משתמשים בשיטות ריצוף גנום מתקדמות ואף נעזרים בטכניקות דימות המאפשרות מעקב אחר שינויים המתקיימים בין היתר במערכת שריר-שלד. הדגש במחקר שלנו ניתן גם על היחסים הפליוטרופיים בין המחלות במערכת השלד ותיסמונות שכיחות אחרות, כגון: סכרת מסוג 2, מנפאוזה (בלות) וזיקנה.
אנו עובדים בשיתוף פעולה עם מעבדות מובילות בעולם.
Publications
Selected publications:
1. Khajuria DK, Karasik D Novel model of restricted mobility induced osteopenia in zebrafish. Journal of Fish Biology 2020; 98 (4), 1031-1038 IF 2.038
2. Christou MA, Ntzani EE, Karasik D. Genetic pleiotropy of bone-related phenotypes: insights from osteoporosis. Current Osteoporosis Reports 2020; 18(5):606-619 DOI: 10.1007/s11914-020-00618-y
3. Jones G*, K. Trajanoska*, A. J Santanasto*, N. Stringa*, C-L Kuo*, JL Atkins* … J M Murabito*, GA Kuchel*, L Ferrucci*, D Melzer*, D Karasik*, F Rivadeneira*, DP Kiel*, LC Pilling*. Genome-wide meta-analysis of muscle weakness identifies 15 susceptibility loci in older men and women. Nat Commun. 2021: 12 (1), 1-11 IF = 12.12
4. Shochat C, Wang Z, Mo C, Nelson S, Donaka R, Huang J, Karasik D*, Brotto M*. Deletion of srebf1, a functional bone-muscle pleiotropic gene, alters bone density and lipid signaling in zebrafish. Endocrinology 2021; 162(1):bqaa189
5. Mesika A, Nadav G, Shochat C, Kalfon L, Jackson K, Khalaileh A, Karasik D, Falik Zaccai T. ngly1 deficiency Zebrafish model manifests abnormalities of the nervous and musculoskeletal systems. Frontiers in Cell and Developmental Biology 2022; 10: 1239
6. Khrystoforova I, C Shochat-Carvalho, R Harari, K Henke, K C Woronowicz, M Harris, Karasik D. Zebrafish mutants reveal unexpected role of Lrp5 in osteoclast regulation. Frontiers in Endocrinology, 2022:13, 985304 IF=5.555
7. Treaster S, Deelen J, Daane J, Murabito J, Karasik D, Harris MT. Convergent genomics of longevity in Rockfishes highlights the genetics of human lifespan variation. Science Advances 2023; 9 (2), eadd2743 IF = 14.136
8. Grinberg L., Dabbah Assadi F, Baum G, Zemel R, Tur-Kaspa R, Shochat C, Karasik D *, Karpuj MV*. Beneficial effect of vitamin D on non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) progression in the zebrafish model. Nutrients: 2023, 15(6), 1362 IF= 5.9
9. Medina-Gomez C, Mullin BH, Chesi A, Prijatelj V, Kemp JP, Shochat-Carvalho C, … van de Peppel J, Ackert-Bicknell CL, Karasik D,, Kague E, Rivadeneira F. Bone Mineral Density Loci Specific to the Skull Portray Potential Pleiotropic Effects on Craniosynostosis. Commun Biol 2023, 6:691 IF = 6.55
10. Ben Zvi I, Karasik D, and Ackert-Bicknell CL Zebrafish as a model for Osteoporosis: Functional validations of Genome Wide Association Studies. Current Osteoporosis Reports 2023;21(6):650-659 IF = 5.7
תאריך עדכון אחרון : 03/09/2024